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Sistema de Información Geográfica de Establecimientos de SaludSIGEESShttp://www.mspbs.gov.py/sigeess/http://www.mspbs.gov.py/sigeess_capacitacion
Sub-Sistema de Información de Estadísticas VitalesSSIEVhttp://ssiev.mspbs.gov.pyhttp://www.mspbs.gov.py/bioestadistica_capacitacion
Sub-Sistema de Información de Servicios de Salud Área AmbulatoriaSAAhttp://saa.mspbs.gov.pyhttp://www.mspbs.gov.py/saa_capacitacion
Sistema de Movimiento HospitalarioSMHhttp://www.mspbs.gov.py/movimientohospitalariohttp://www.mspbs.gov.py/movhospital_capacitacion
Sistema de Egresos HospitalariosSEGHOSPhttp://www.mspbs.gov.py/seghosphttp://www.mspbs.gov.py/seghosp_capacitacion
Sistema de Información y Control de Inventarios Automatizado del ParaguaySICIAPhttps://siciap.mspbs.gov.py http://www.mspbs.gov.py/siciap_capacitacion
Sistema Informático de la Dirección General de Vigilancia de la SaludSIDGVShttp://www.mspbs.gov.py/sidgvshttp://www.mspbs.gov.py/sidgvs_capacitacion
Sistema Experto de la Unidad de Salud de la FamiliaUSFhttp://www.mspbs.gov.py/seusfhttp://www.mspbs.gov.py/seusf_capacitacion
Sistema Experto del Programa Nacional de Control de la TuberculosisPNCThttp://www.mspbs.gov.py/sepncthttp://www.mspbs.gov.py/sepnct_capacitacion
Sistema Experto del Programa Nacional de Control de VIH/SIDA/ITSPRONASIDAhttp://www.mspbs.gov.py/sepronasidahttp://www.mspbs.gov.py/sepronasida_capacitacion
Sistema del Programa Nacional de Asistencia Alimentaria NutricionalPROANhttp://www.mspbs.gov.py/proan 
Sistema Informático del Programa Ampliado de InmunizacionesPAIhttp://www.mspbs.gov.py/paiinfovacparaguay http://www.mspbs.gov.py/paiinfovacparaguay_capacitacion/
Sistema Informático de Registro de Profesionales de la Salud.SIREPROhttp://www.mspbs.gov.py/sirepro/ 
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